v0.5.0-beta.4

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Bug 修复

• .trellis/workflow.md 现在真的会被 trellis update 覆盖更新。 0.5 升级的关键修复。 workflow.md 从早期 Trellis 版本开始就被明确排除在 collectTemplateFiles 之外，当时的设计假设是”workflow.md 是用户可定制文档，init 时写一次，之后 update 不碰”。这个假设在 0.5.0 崩了 —— 因为 workflow.md 开始承担脚本解析的结构：
  • ## Phase Index —— 被 get_context.py --mode phase 读取
  • ## Phase 1/2/3 标题 —— 内联进 9.5 KB 的 SessionStart payload
  • [workflow-state:STATUS] 标签块 —— 被每轮面包屑 hook 消费
  从 0.4.x 升到 0.5 的用户就踩坑了：get_context.py 报 Phase Index section not found in workflow.md，新加的 /continue 命令无法解析 step 路由。 workflow.md 现在进入正常的 update 流程。 未修改过的自动更新，改过的走已有的 “Modified by you” 冲突 prompt（带 diff 预览）。workspace/index.md 保持排除 —— 它是 add_session.py 运行时追加的 journal index，没有脚本依赖的结构。

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已经升到 beta.0..beta.3 踩坑的用户

trellis update --migrate

• 没改过 workflow.md：自动更新（显示在 “Template updated (will auto-update)” 段里）
• 改过 workflow.md：弹 Modified by you confirm prompt + diff 预览。选 [1] Overwrite 换成新 0.5 结构；或者选 [3] Skip 手动把你的改动 merge 到新模板里（全局安装的 CLI 里，模板路径是 packages/cli/dist/templates/trellis/workflow.md）